台灣光復以來，政府重視人才培育，戮力於教育發展，本校應運於民國四十五年創立。初為南投縣國姓初級中學，由廖天榜先生兼任校長，旋由陳東榮先生擔任首任校長。初期創校維艱，篳路藍縷。有賴全校師生胼手胝足，闢建校舍，初具規模。

民國四十八年魯佐卿先生接任校長，因魯氏苦心經營，校務得以蒸蒸日上。 民國五十七年八月延長九年國教，本校更名為南投縣立國姓國民中學。積極鼓勵鄉內子弟就學，因此學生年年增加。

民國六十四年八月一日成立北梅分部，民國六十六年曾正治先生接掌本校，民國六十八年北梅分部奉准獨立為南投縣立北梅國民中學。

民國七十二年黃金瑞先生調任本校，為促進地方教育之發展，及適應地方實際之需要，戮力於校舍擴建及設備充實。 民國七十九年王錦賜校長接任本校，因人口外流，學生人數驟減，民國八十一年改為偏遠地區學校。

民國八十一年九月曾錦泉先生調任本校校長，民國八十七年八月由池麗娟女士接掌本校。，積極規劃及推動「小而美」學習型校園；任內遭逢「921大地震」，持校長銜命重建，符合現代化建築美學新校舍於91年4月15日落成啟用，89年1月池校長引薦黃泰吉、廖德蘭教練夫婦到校推廣空手道運動，創立「國姓國中空手道」隊，教導學生崇德、尚武、強身，調合身心靈重建。多年來征戰國內、外，成績斐然，享譽國際。

民國九十一年八月張日新先生調任本校校長。積極協辦社區大學進駐本校，95年成立口琴隊，成立之初，在資源有限、教費不足、樂器匱乏，幸賴師生勤練不懈，年年在縣內及全國音樂比賽中大放異彩，屢創佳績。

民國九十九年八月陳國俊先生榮調母校第九任校長，除賡續口琴隊訓練，更積極推動客語教學，成為學校發展特色，成立桌球隊、排球隊，強健學生體魄，及推廣書香閱讀、晨讀，活化學生學習，為學生語文基礎素養扎根，實現「禮義廉恥、勤奮創新」的校訓，目前全校計11班，學生284人，教職員工42人。

本校地處民風純樸的國姓鄉行政中心區，四面環山，景致宜人，成為莘莘學子求知之佳所。創立迄今，已近一甲子的歲月，經歷任校長嘔心瀝血、精心擘劃與地方士紳及全校教職員工之協力經營，始具規模，然不幸在民國八十八年九月二十一日遭逢台灣百年首見之七級大地震，校舍經不起天搖地動幾成危樓，經上級人員鑑定列為危險建築，旋於十月中由國軍協助拆除部分教室及辦公室，僅存後期新建的活動中心及總務處辦公室也需整修加強。在此危急時刻端賴政府、民間團體及善心人士的協助，簡易教室也在短期間搭建完成，使學生能安心上學，校舍之重建也靠政府牽線由台視公司捐款新台幣七千多萬元，並協調慈濟慈善基金會認養新台幣二億四千多萬元參與協建工作，重建設計委由姜修恆建築師規劃，在師生家長眾人殷盼下規劃完成，並於八十九年十二月五日動土興建，由順鼎營造公司承造，期間到校關心工程進行的上級長官，如教育部范次長巽綠及監委照榮耀等多人，而慈濟的證嚴上人、林副總及委員、師兄、師姐們，更是像辦自家的事一樣時時關懷處處協助。硬體結構完成後，師生選在九十年十二月二十八日，以接力方式完成搬家工作，接著進行景觀工程，由北區慈誠隊基隆中隊協助進行，耗時五個月美輪美奐校園於焉完成，並於九十一年四月二十一日在眾人祝福下落成啟用。

十年樹木，百年樹人，教育乃百年大計，本校對教師素養之提升、教學方法之革心、教學設備之充實、校務行政之推廣，莫不全力以赴，將12年國教改革融合於學校整體建設中，在校務措施方面除保留優良傳統外，特致力於純樸學風之發揚，提倡藝文活動參與及讀書風氣之培養，加強人文精神，落實生活與品格教育，培養深富創意與成熟思考的學生，期許學生發展健全身心及五育均衡，成為具前瞻性發展之現代全人。